MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalobacter sp. CF chromosome

Total Repeats: 51118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018867	TA	3	6	15	20	50 %	50 %	0 %	0 %	410659621
2	NC_018867	CAA	2	6	123	128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410659621
3	NC_018867	CTGG	2	8	168	175	0 %	25 %	50 %	25 %	410659621
4	NC_018867	CTCG	2	8	189	196	0 %	25 %	25 %	50 %	410659621
5	NC_018867	GCA	2	6	385	390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410659621
6	NC_018867	CGG	2	6	441	446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410659621
7	NC_018867	ATGC	2	8	472	479	25 %	25 %	25 %	25 %	410659621
8	NC_018867	AATGA	2	10	550	559	60 %	20 %	20 %	0 %	410659621
9	NC_018867	TTA	2	6	622	627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659621
10	NC_018867	GGCA	2	8	648	655	25 %	0 %	50 %	25 %	410659621
11	NC_018867	AAG	2	6	656	661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659621
12	NC_018867	GAA	2	6	670	675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659621
13	NC_018867	CAA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410659621
14	NC_018867	ATT	2	6	721	726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659621
15	NC_018867	GA	3	6	744	749	50 %	0 %	50 %	0 %	410659621
16	NC_018867	TTCG	2	8	773	780	0 %	50 %	25 %	25 %	410659621
17	NC_018867	AAC	2	6	798	803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410659621
18	NC_018867	A	6	6	850	855	100 %	0 %	0 %	0 %	410659621
19	NC_018867	TGA	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659621
20	NC_018867	ATT	3	9	889	897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659621
21	NC_018867	AACC	2	8	979	986	50 %	0 %	0 %	50 %	410659621
22	NC_018867	AGA	2	6	1005	1010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659621
23	NC_018867	A	6	6	1070	1075	100 %	0 %	0 %	0 %	410659621
24	NC_018867	AGA	2	6	1118	1123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659621
25	NC_018867	AAGAAC	2	12	1125	1136	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410659621
26	NC_018867	TCTT	2	8	1188	1195	0 %	75 %	0 %	25 %	410659621
27	NC_018867	GGA	2	6	1219	1224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410659621
28	NC_018867	TCAT	2	8	1241	1248	25 %	50 %	0 %	25 %	410659621
29	NC_018867	A	9	9	1272	1280	100 %	0 %	0 %	0 %	410659621
30	NC_018867	ATT	2	6	1312	1317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659621
31	NC_018867	GATTT	2	10	1617	1626	20 %	60 %	20 %	0 %	410659622
32	NC_018867	TCC	2	6	1656	1661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410659622
33	NC_018867	GAA	2	6	1779	1784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659622
34	NC_018867	GTT	2	6	1791	1796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410659622
35	NC_018867	T	6	6	1810	1815	0 %	100 %	0 %	0 %	410659622
36	NC_018867	AAT	2	6	1869	1874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410659622
37	NC_018867	GAA	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659622
38	NC_018867	TGC	2	6	2059	2064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410659622
39	NC_018867	ATT	2	6	2166	2171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659622
40	NC_018867	GAT	2	6	2211	2216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659622
41	NC_018867	ATT	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659622
42	NC_018867	AT	3	6	2355	2360	50 %	50 %	0 %	0 %	410659622
43	NC_018867	GATG	2	8	2372	2379	25 %	25 %	50 %	0 %	410659622
44	NC_018867	CT	3	6	2393	2398	0 %	50 %	0 %	50 %	410659622
45	NC_018867	ATCA	2	8	2466	2473	50 %	25 %	0 %	25 %	410659622
46	NC_018867	ATC	2	6	2559	2564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659622
47	NC_018867	GTT	2	6	2577	2582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410659622
48	NC_018867	ATC	2	6	2615	2620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659622
49	NC_018867	TTA	2	6	2848	2853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659623
50	NC_018867	G	6	6	2899	2904	0 %	0 %	100 %	0 %	410659623
51	NC_018867	TC	3	6	2918	2923	0 %	50 %	0 %	50 %	410659623
52	NC_018867	TTA	2	6	2966	2971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659623
53	NC_018867	A	7	7	2981	2987	100 %	0 %	0 %	0 %	410659623
54	NC_018867	GAT	2	6	3066	3071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659623
55	NC_018867	A	6	6	3084	3089	100 %	0 %	0 %	0 %	410659623
56	NC_018867	AAG	2	6	3101	3106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659623
57	NC_018867	CTG	2	6	3120	3125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410659623
58	NC_018867	A	6	6	3203	3208	100 %	0 %	0 %	0 %	410659623
59	NC_018867	T	6	6	3349	3354	0 %	100 %	0 %	0 %	410659623
60	NC_018867	A	6	6	3395	3400	100 %	0 %	0 %	0 %	410659623
61	NC_018867	A	7	7	3444	3450	100 %	0 %	0 %	0 %	410659623
62	NC_018867	GA	3	6	3465	3470	50 %	0 %	50 %	0 %	410659623
63	NC_018867	CGA	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410659623
64	NC_018867	AAT	2	6	3503	3508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410659623
65	NC_018867	CAG	2	6	3555	3560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410659623
66	NC_018867	GCTG	2	8	3584	3591	0 %	25 %	50 %	25 %	410659623
67	NC_018867	ATC	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659623
68	NC_018867	CTG	2	6	3636	3641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410659623
69	NC_018867	GAT	2	6	3642	3647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659623
70	NC_018867	TTCT	2	8	3649	3656	0 %	75 %	0 %	25 %	410659623
71	NC_018867	ATC	2	6	3720	3725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659623
72	NC_018867	AGG	2	6	3798	3803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410659623
73	NC_018867	TAA	2	6	3830	3835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410659624
74	NC_018867	TAT	2	6	3836	3841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659624
75	NC_018867	CAG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410659624
76	NC_018867	TTG	2	6	3912	3917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410659624
77	NC_018867	ATG	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659624
78	NC_018867	GAAAA	2	10	3964	3973	80 %	0 %	20 %	0 %	410659624
79	NC_018867	TGA	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659624
80	NC_018867	TTC	2	6	4016	4021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410659624
81	NC_018867	CAAAT	2	10	4290	4299	60 %	20 %	0 %	20 %	410659625
82	NC_018867	CCA	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410659625
83	NC_018867	TTA	2	6	4482	4487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659625
84	NC_018867	TCA	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659625
85	NC_018867	GA	3	6	4497	4502	50 %	0 %	50 %	0 %	410659625
86	NC_018867	ATGC	2	8	4544	4551	25 %	25 %	25 %	25 %	410659625
87	NC_018867	CGG	2	6	4600	4605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410659625
88	NC_018867	TAA	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410659625
89	NC_018867	TGG	2	6	4636	4641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410659625
90	NC_018867	GTT	2	6	4664	4669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410659625
91	NC_018867	A	6	6	4703	4708	100 %	0 %	0 %	0 %	410659625
92	NC_018867	GTAC	2	8	4773	4780	25 %	25 %	25 %	25 %	410659625
93	NC_018867	AAT	2	6	4955	4960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410659625
94	NC_018867	TGAT	2	8	4965	4972	25 %	50 %	25 %	0 %	410659625
95	NC_018867	TAAA	2	8	4986	4993	75 %	25 %	0 %	0 %	410659625
96	NC_018867	TCA	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659625
97	NC_018867	ATA	2	6	5043	5048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410659625
98	NC_018867	TAA	2	6	5110	5115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410659625
99	NC_018867	GTT	2	6	5174	5179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410659625
100	NC_018867	CG	3	6	5188	5193	0 %	0 %	50 %	50 %	410659625
101	NC_018867	ATT	2	6	5264	5269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659625
102	NC_018867	GACA	2	8	5301	5308	50 %	0 %	25 %	25 %	410659625
103	NC_018867	TGGT	2	8	5355	5362	0 %	50 %	50 %	0 %	410659625
104	NC_018867	T	7	7	5377	5383	0 %	100 %	0 %	0 %	410659625
105	NC_018867	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659625
106	NC_018867	TTG	2	6	5412	5417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410659625
107	NC_018867	GCC	2	6	5450	5455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410659625
108	NC_018867	CTT	2	6	5502	5507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410659625
109	NC_018867	GGC	2	6	5585	5590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410659625
110	NC_018867	GAA	2	6	5604	5609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659625
111	NC_018867	T	7	7	5834	5840	0 %	100 %	0 %	0 %	410659625
112	NC_018867	CAAA	2	8	5917	5924	75 %	0 %	0 %	25 %	410659625
113	NC_018867	TAAG	2	8	5952	5959	50 %	25 %	25 %	0 %	410659625
114	NC_018867	GAT	2	6	6089	6094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659625
115	NC_018867	A	7	7	6273	6279	100 %	0 %	0 %	0 %	410659626
116	NC_018867	ATT	2	6	6290	6295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659626
117	NC_018867	ATGA	2	8	6376	6383	50 %	25 %	25 %	0 %	410659626
118	NC_018867	ATG	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659626
119	NC_018867	GCTG	2	8	6624	6631	0 %	25 %	50 %	25 %	410659626
120	NC_018867	ATG	2	6	6668	6673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659626
121	NC_018867	TTC	2	6	6732	6737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410659626
122	NC_018867	CCG	2	6	6769	6774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410659626
123	NC_018867	CGT	2	6	6801	6806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410659626
124	NC_018867	TGA	2	6	6866	6871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659626
125	NC_018867	TTA	2	6	6875	6880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659626
126	NC_018867	GGAA	2	8	6921	6928	50 %	0 %	50 %	0 %	410659626
127	NC_018867	TCA	2	6	6929	6934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659626
128	NC_018867	ATCA	2	8	6957	6964	50 %	25 %	0 %	25 %	410659626
129	NC_018867	A	6	6	6989	6994	100 %	0 %	0 %	0 %	410659626
130	NC_018867	A	7	7	6998	7004	100 %	0 %	0 %	0 %	410659626
131	NC_018867	GTT	2	6	7021	7026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410659626
132	NC_018867	GAAAA	2	10	7090	7099	80 %	0 %	20 %	0 %	410659626
133	NC_018867	GAA	2	6	7353	7358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659626
134	NC_018867	AGA	2	6	7362	7367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659626
135	NC_018867	TTG	2	6	7379	7384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410659626
136	NC_018867	TTC	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410659626
137	NC_018867	GAT	2	6	7447	7452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659626
138	NC_018867	GCCAAA	2	12	7459	7470	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410659626
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261	NC_018867	ATCTCG	2	12	15200	15211	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410659632
262	NC_018867	CTC	2	6	15230	15235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410659632
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268	NC_018867	T	7	7	15601	15607	0 %	100 %	0 %	0 %	410659633
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497	NC_018867	TGA	2	6	29528	29533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659648
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